授業の形態
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講義
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アクティブラーニング
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学生が自身の考えを発表する
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授業内容と方法
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生体情報は、病気の診断やセキュリティシステムなど日常の様々な場面で活用されている。その生体情報の特徴量を数理的解析により理解および抽出できることを目指す。生体情報のデータの種類や準備の方法、特徴量としてのリズム性やカオス性などを解析および定量評価する手法を概説する。また、微分方程式の数値解析手法を概説する。それら基礎講義に加えて、学生自身のそれぞれの学術論文の内容に関するデータについて、生体情報処理の技術を用いて実践的な解析に取り組む。
第1週目はオンラインで実施します。 https://us02web.zoom.us/j/84858996959?pwd=SVh1VW5KcXBRSm9VSng2d0szRVY3QT09
第2週目以降は履修者数などによって調整します。
授業資料はこちら。 https://docs.google.com/document/d/1i4hhUz39Ob3VEFKo7lvFT4Dme3h9JUOwUKgsLGImj2A/edit?usp=sharing
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URGCC学習教育目標
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自律性、専門性
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達成目標
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・生体情報データの種類や準備の方法を説明できる。 ・生体情報解析の基盤となる信号処理の手法を説明できる。 ・生体情報を不規則な時系列信号として扱い、その特徴解析の手法を概説できるとともに、特徴解析を実践できる。 ・微分方程式の数値シミュレーションを実施できる。
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評価基準と評価方法
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以下によって上記目標の達成度を評価する。
(1) レポート内容に関する発表 - (2)で作成するレポートの内容をスライドにまとめ、5-10分程度で発表する。 - 他の履修者からの質疑に応答する。 - スライドおよび質疑応答に基づいて内容理解度を評価する。 - スライドには実践的に解析した事例を含むこととする。
(2) 生体情報解析の実践結果に関するレポート - 達成目標に関する内容を実際のデータ解析結果と関連させて論述する。 - 分量:3000~6000文字程度(A4用紙2~4ページ程度) - 達成目標に照らし、特に以下の項目を評価する。 - 授業で取り上げたテーマに関するキーワードを理解しているか。 - 自身の考え、解析結果、書籍等による調査に基づく知見などが記述されているか。 - 適切な日本語で論理的に記述されているか。
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履修条件
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授業では基礎的なプログラミングスキルを修得していることを前提とし、データ解析を実施する。プログラミング環境の構築は各自で行うものとする。授業ではpython言語でサンプルコードを示す。微積分や線形代数学などの基礎知識を習得していることを前提に授業を行う。
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授業計画
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2023/10/5 第1-2回: イントロダクション、データの種類と準備、微分方程式の数値解析手法
2023/10/12 第3-4回: 微分方程式の数値解析(ロジスティック写像)
2023/10/19 第5-6回: 周波数変換、相関解析(時間相関、空間相関)、
2023/10/26 第7-8回:ウェーブレット解析、位相差解析
2023/11/02 第9-10回: カオス解析、フラクタル解析
2023/11/09 第11-12回: データ解析実践(1)
2023/11/16 第13-14回: データ解析実践(2)
2023/11/30 第15回: データ解析に関する学生発表
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事前学習
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予習の必要はないので、その分の時間を復習に使うこと。
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事後学習
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授業内容を復習するとともに,授業内容に関する文献調査を行う。また、プログラムを作成して解析手法の理解を深めること。
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教科書にかかわる情報
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教科書全体備考
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参考書にかかわる情報
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4339071323
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ME教科書シリーズ / 日本エム・イー学会編, A-2
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佐藤俊輔, 吉川昭, 木竜徹共著
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コロナ社
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2004
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4871885607
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井庭崇, 福原義久著
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NTT出版
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1998
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4782810105
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合原一幸編 ; 池口徹, 山田泰司, 小室元政著
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産業図書
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2000
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4339033812
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計測・制御セレクションシリーズ / 計測自動制御学会編, 1
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藤原幸一, 久保孝富編著 ; 山川俊貴 [ほか] 共著
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コロナ社
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2021
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参考書全体備考
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特になし。必要に応じて資料を配布する。
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使用言語
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英語
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メッセージ
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履修登録者が日本人のみの場合には日本語で授業を行う。
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オフィスアワー
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随時対応。メールもしくはMattermostのDMで連絡すること。
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メールアドレス
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この項目は教務情報システムにログイン後、表示されます。
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URL
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